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Nous proposons de présenter le concept de la biologie intégrative et des systèmes en utilisant comme exemples les travaux de chercheurs chevronnés provenant majoritairement du Québec et de quelques conférenciers invités de l’extérieur. Le but du colloque est de faire connaître les approches et l’impact sur la recherche québécoise dans un modèle intégré en sciences biologique et biomédicale. L’approche scientifique proposée par la biologie intégrative et des systèmes permettra de faire face au défi de la recherche du prochain millénaire : comprendre la complexité des systèmes biologiques. Le concept d’innovation par la recherche intégrée a donné des percées remarquables en santé humaine, en environnement et dans l’étude de l’évolution des espèces en utilisant les nouvelles technologies de la génomique, de la biologie cellulaire et moléculaire et de la bio-informatique. La quantité phénoménale d’information à caractères biologiques nécessite une nouvelle approche intégrée d...

See original: La biologie intégrative et des systèmes : santé, environnement et évolution

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Le potentiel de création de richesse et les défis d’aménagement, de valorisation et de transformation des ressources naturelles sont multiples. Cette session met en valeur la diversité des contributions scientifiques permettant de mieux caractériser ces ressources et d’en améliorer la gestion de manière à mieux répondre aux besoins de la société et du consommateur. Les thèmes abordés sont aussi diversifiés que la forêt, l’eau, l’alimentation, les bio-énergies. Que ce soit par la biochimie, la microbiologie, la foresterie ou la nutrition végétale, la recherche scientifique dans le domaine continue à apporter des solutions à de nombreux enjeux. Les connaissances acquises et les méthodes analytiques optimisées seront de plus en plus essentielles pour répondre à la demande croissante en ressources de la population humaine et contrer les effets des changements climatiques de plus en plus présents.

Responsable

John Mackay Université Laval

Programme

http://www.acfas.ca/evenements/c...

See original: Ressources naturelles

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Les problèmes environnementaux et de santé publique sont devenus des enjeux très importants dans la société. La recherche en sciences marines permet non seulement de comprendre l’environnement maritime mais aussi de soutenir la découverte et l’avancement des connaissances fondamentales et appliquées, dans une perspective de développement durable. La préservation et la valorisation de la ressource aquatique sont également des motifs de préoccupation mondiale en tant que valeur économique et on doit la considérer comme une protection essentielle à assurer aux biens que l’océan fournit à l’humanité. De plus, la mise en évidence d’effets bénéfiques sur la santé à partir de composés issus de la mer représente un défi important et novateur dans la production de nouveaux aliments fonctionnels et agents nutraceutiques.

Ce colloque est divisé en deux sessions. La première intitulée Exploitation des ressources marines : risques et bienfaits présente notamment les phénomènes de proli...

See original: Les sciences de la mer au cœur des enjeux environnementaux et de santé publique

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L’économie verte répond à l'ensemble des activités économiques générées par toutes les entreprises qui produisent des biens et services contribuant à éviter, réduire ou supprimer des nuisances pour l'environnement. Le Québec figure parmi les économies appliquant les normes de protection de l’environnement les plus hautes, avec comme toile de fond le développement durable. Il s’inscrit comme un chef de file dans la lutte contre les changements climatiques. 

Les procédés de fabrication de la plupart des matériaux consomment de grandes quantités d’énergie et de matières premières dont les réserves sont limitées. L’utilisation de matériaux fabriqués à base de végétaux est un excellent substitut aux matières premières minérales non renouvelables. Le bois est un matériau exemplaire, entièrement naturel et renouvelable. En effet, l’énergie solaire renouvelable permet la production constante de bois par photosynthèse et absorption du CO₂.  

La journée de colloque intitulée « Matéri...

See original: Matériaux renouvelables à l’ère d’une économie verte

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L’impact des activités humaines sur l’environnement reste encore un enjeu majeur. Bien que les sociétés modernes comprennent mieux les immenses services que rendent l’environnement et le prix souvent élevé d’un dérèglement de la nature, beaucoup de travaux restent à faire afin de mieux saisir la complexité de ces enjeux ou afin de limiter nos impacts, voire à amenuiser leurs conséquences. Trois sessions stimulantes et multidisciplinaires ont été montées en ce sens. La première aborde les forces complémentaires exercées par l’eau et la géologie, à différentes échelles spatiales et temporelles, pour façonner le paysage que nous occupons et exploitons. La seconde porte sur l’utilité et la pertinence des accords environnementaux, notamment sous le regard de l’aménagement forestier. Finalement, la troisième session propose un regard plus local, en étudiant le contrôle exercé sur diverses communautés végétales.

Responsable

François Anctil Université Laval

Programme

http://www.acfas...

See original: Environnement

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Ce colloque permettra de faire connaître, à l’aide d’exemples concrets et de présentations s’adressant à un public de chercheurs, d’étudiants et de gestionnaires, le rôle joué par la génomique pour fournir des solutions aux enjeux du développement durable. 

Le concept de développement durable a été élaboré dans les années 80. Selon le Rapport Brundtland (1987), ce développement doit « répondre aux besoins du présent sans compromettre la capacité des générations futures à répondre aux leurs ». Pour y parvenir, des solutions novatrices aux enjeux environnementaux et sociaux-économiques doivent être identifiées rapidement.

 Au cours de la dernière décennie des investissements majeurs ont été consentis en génomique au Canada et ailleurs. L’objectif ultime était d’acquérir de nouvelles connaissances et de développer des ressources applicables dans toutes les sphères des sciences de la vie. Dans le domaine non médical, ces projets commencent à générer des retombées directes et in...

See original: Génomique et développement durable : de nouvelles pistes de solutions

successor to sweave in that it integrates R an LaTeX, but aims to be a more extensible superset, integrating python, HTML, markdown, restructuredtext...

See original: knitr: Elegant, flexible and fast dynamic report generation with R | knitr

Coordination du numéro : Damien Conaré (Chaire Unesco Alimentations du monde/Montpellier SupAgro, France), Steve Déry ([VertigO]/ Université Laval, Canada), Patrick Mundler (Université Laval, Canada), Pascal Thériault (Université McGill, Canada) et Eric Duchemin ([VertigO]/UQÀM, Canada)

[VertigO] - La revue électronique en sciences de l’environnement prépare un nouveau dossier qui paraîtra en mai 2014. Pour ce dossier, nous recherchons des analyses et des recherches sur les thèmes de l’agriculture et de la sécurité alimentaire.

La malnutrition et l’insécurité alimentaire touchent 870 millions de personnes (FAO, 2012) avec une aggravation de la situation dans certaines parties du monde, principalement en Afrique. Pourtant, une grande majorité de ces populations vivent encore en milieu rural, d’où le rôle essentiel que peut jouer l’agriculture, tant pour améliorer les disponibilités alimentaires que pour générer des revenus. En outre, avec une urbanisation croissante et une présence acc...

See original: Des systèmes alimentaires articulés et transversaux pour une sécurité alimentaire

(1881)

by Ellen Mary Clerke

Who calls me dark ? for do I not display
Wonders that else man's eye would never
see?
Waste in the blank and blinding glare of Day,
The heavens bud forth their glories but to me.

Is it not mine to pile their crystal cup,
Drain'd by the thirsty sun and void by day.
Brimful of living gems, profuse heap'd up.
The bounteous largesse of my royal way ?

Mine to call o'er at dusk the roll of heav'n.
Array its glittering files in order due ?
To beckon forth the lurking star of Even,
And bid the constellations start to view ?

The wandering planets to their paths recall.
And summon to the muster tenant spheres.
Till thronging to my standard one and all,
They crowd the zenith in unfathom'd tiers ?

Do I not lure stray sunbeams from the day.
To hurl them broadcast as wing'd meteors
forth ?
Strew sheaves of fiery arrows on my way.
And blazon my dark spaces in the north ?

Is not a crown of lightnings mine to wear.
When polar flames suffuse my skies with
splendour ?
And mine the homage with the sun to share.
His vagrant vassals rush through space to
render ?

Who calls me secret ? are not hidden things.
Reveal'd to science when with piercing sight
She looks beneath the shadow of my wings.
To fathom space and sound the infinite ?

In plasmic light do I not bid her trace
Germs from creation's dawn maturing slow ?
And in each filmy chaos drown'd in space
See suns and systems yet in embryo ?

(Source: Huggins, 1907)

See original: NIGHT'S SOLILOQUY

This plaque in Skibbereen, in West Cork marks the birthplace of the sisters Ellen and Agnes Clerke, both noted writers, particularly on the science of astronomy.

Living together in Skibbereen, Italy and London for most of their lives, the women pursued a common interest in science and, in particular, in the communication and popularisation of the subject.

Although the family moved to Dublin in 1861 and to Queenstown (Cobh) in 1863, the sisters spent much of their childhood in West Cork. Due to their father's wealth and stature, the family was able to spend the cold winters in Rome (1867 and 68); Naples (1871 and 1872); Florence (1873-76). The sisters made the most of these trips abroad - spending many days reading in the Florence Public Library.

Agnes Mary Clerke (left) and Ellen Mary Clerke

The sisters only brother Aubrey noted the defining influence of their father, John William Clerke, on the scientific aptitude of the sisters:

"Although a classical scholar of Trinity College, Dublin", wrote Aubrey Clerke in 1907,"his interests were for the most part scientific".

"In our earliest years his recreation was chemistry, the consequential odours of which used to excite the wrath of our Irish servants. Later a 'big telescope' (4 inch aperture)was mounted in the garden, and we children were occasionally treated to a glimpse of Saturn's rings or Jupiter's satellites".

"These trivial things show that it was in an environment of scientific suggestion that our early lives were passed", wrote Aubrey Clerke in a foreword to a booklet recalling his sisters' lives.

The Clerke family home in Skibbereen

The family moved to London in 1877 and Agnes published the A Popular History of Astronomy during the Nineteenth Century in 1885. Her second book The System of the Stars was published in 1890.

Agnes Clerke was not a practicing astronomer and her contribution to the field is largely based on her tireless collation and interpretation of data from other researchers and the communication of that research. She could, perhaps, be best described as a science communicator, using today's language.

Despite not working as an astronomer herself, she had, of necessity a vast knowledge of the area and spent a three month period in 1888 at the Cape Observatory (Cape Town) updating her knowledge.

Clerke Crater on the lunar surface

Agnes Clerke was a recipient, in 1893, of the Actonian Prize from the Royal Institution in London. This award, presented every years, was awarded the person who "in the judgement of the committee of managers for the time being of the Institution, should have been the author of the best essay illustrative of the wisdom and beneficence of the Almighty, in such department of science as the committee of managers should, in their discretion, have selected".

A member of the British Astronomical Association, Agnes was also an honorary member of the Royal Astronomical Society.

Ellen Clerke is also known for some astronomical writings including the pamphlets "Jupiter and His System" and "The Planet Venus" but she was also known as a journalist, poet, novelist and commentator on religious issues, with a keen interest in Italian matters having lived in the country for several years.

Ellen's poem Night's Soliloquy, beautifully captures her and here sister's love of astronomy.

Agnes has the distinction of having a crater on the surface of the moon named in her honour. Crater Clerke is about 6 km in diameter and located very close to the Apollo 17 landing site - the last landing of humans on the lunar surface.

Ellen died after a short illness on March 2nd 1906. Huggins notes that "these sisters were lovely and pleasant in their lives and in death they were but little divided". Agnes died on January 20th 1907 from complications associated with pneumonia.

See original: "She looks beneath the shadow of my wings"

Louise Vandelac, c0-directrice de [VertigO], fait valoir, à la Commission Canadienne pour l’Unesco, depuis plusieurs années l’importance de l’interdisciplinarité dans la recherche et le nécessaire arrimage entre la recherche et la société civile. Depuis un an, elle est présidente de la Commission sectorielle Sciences naturelles, sociales et humaines.  Directrice de l’Institut des sciences de l’environnement (ISE) et professeure au Département de sociologie de l’UQAM, elle met de l’avant des réflexions et analyses partagées par les membres de comité de rédaction de la revue.  Soulignons [...]

See original: [VertigO] à la commission canadienne pour l’Unesco : Louise Vandelac, co-directrice de la revue, est présidente d’une commission sectorielle

Forget-Table is a database for storing non-stationary categorical distributions that forget old observations responsibly. It has been designed to store millions of distributions and can be written to at a high volume. "Forgetting" from a distribution is done by simulating a Poisson process with a user-specified rate. This results in equalizing all bins in a distribution such that, if no new observations are added in, the distribution will approach uniform.

See original: http://bitly.github.com/forgettable/

understand regression and classification algorithms but visualising them in action

See original: MLDemos - A visualization tool for machine learning

New Irish #SciComm venture Walton Magazine hits the airwaves tonight when they pitch their wares on Dragon's Den.

Magazine editor John O'Donoghue and PR Manager Ger O'Donovan braved the den to get funding for their fledgling science communication magazine.

The magazine was launched in the Autumn of 2012 and deals with STEM issues from an Irish perspective. My own articles for Walton have dealt with current research on the potato as well as the future of food production and the importance of plant pathology.

You can see Walton Magazine take on the Dragons tonight (Easter Sunday, 31st March) at 9.30pm on RTE One television and join in the conversation on twitter @waltonmagazine using the hashtag  #ddirl

See original: Science Communication enters the Dragon's Den

microsoft's domain-specific probabilistic language

See original: Infer.NET - Microsoft Research